桥本氏甲状腺炎最大的危害是发生甲状腺功能减退症。
由于发生甲状腺功能减退症，可以发生低代谢综合征的一些临床症状从而损伤身体。桥本氏甲状腺炎是一种慢性淋巴细胞性甲状腺炎，属于自身免疫性疾病，其特征是甲状腺组织被淋巴细胞取代，甲状腺激素合成、分泌逐渐减少，最终引起甲状腺功能减退症。此时临床怕冷少汗，不思饮食，表情模糊，粘液水肿、粘液蛋白沉积介于皮肤与组织之间，皮肤光滑受压无孔，大便干燥次数少，重症患者出现心包积液、心力衰竭。这些症状如果不加以控制就会造成严重后果。桥本氏甲状腺炎如发生甲减，需用左甲状腺激素替代治疗。