甲状腺疾病可由多种病因引起，一般原因如下：
1、碘源性因子碘是合成甲状腺激素的重要物质，碘缺乏可引起甲状腺肿，甲状腺功能减退等；过量摄入碘会引起碘源性甲状腺功能亢进症。
2、自身免疫因子-毒性弥漫性甲状腺肿是临床俗称的甲状腺功能亢进症，最常见。它主要由自身免疫过程和精神刺激引起
3、家族遗传因子-家族遗传酶缺陷可引起甲状腺激素合成障碍，导致甲状腺肿和甲减。
4、治疗不当，如医源性因素-手术、放射性碘、甲状腺功能低下的治疗药物等，可引起甲状腺功能低下；过量服用甲状腺激素可引起药源性甲状腺功能亢进症。