甲状腺球蛋白过高的情况，应针对不同原因制定不同的治疗方案。
甲状腺球蛋白过多的原因多为甲状腺功能亢进症、亚急性甲状腺炎、桥本甲状腺炎、甲状腺癌等，治疗方案因原因而异。甲状腺功能亢进导致甲状腺球蛋白过高时服用碘-131，同时过着患者应保持吃无碘盐的生活方式。另一方面，亚急性甲状腺炎是一种可以自行治愈的疾病，如果因为这种原因甲状腺球蛋白过高，暂时就不需要治疗了。甲状腺癌所致甲状腺球蛋白过高需治疗手术，手术后仍需定期监测甲状腺球蛋白。