甲状腺过氧化物酶由甲状腺滤泡细胞合成，是催化甲状腺激素合成的重要酶。
甲状腺过氧化物酶由900多个氨基酸残基组成，分子量近103kd，为10%糖化的含色素蛋白，羧基端一端在细胞膜中，大部分在滤泡腔中。甲状腺过氧化氢酶以过氧化氢为氧化剂，促进甲状腺激素合成的多个阶段。患者切除脑垂体后，过氧化氢酶活性明显降低。而临床使用的抗甲状腺药物如硫脲类、咪唑类等，就是通过抑制甲状腺激素合成来抑制过氧化物酶，从而治疗甲状腺功能亢进。