甲状腺结节的发病原因是碘的异常、激素合成的障碍等多种因素复合作用的结果。其中包括常见的基本病因和诱发因素，如下：
1、碘缺乏可引起甲状腺结节。无论是正常成人还是生长期儿童，都需要每天摄入充足的碘，甲状腺激素甲状腺激素是甲状腺分泌的激素。
2、高碘同样引起甲状腺结节，罕见是引起甲状腺结节的原因。使用含碘药物可能引起甲状腺结节。
3、家族性遗传性疾病可出现基因遗传缺陷，通常为常染色体隐性遗传。原因是甲状腺合成酶的遗传缺陷，引起甲状腺激素合成缺陷，或水解酶缺乏。甲状腺激素合成后不能正常释放，可导致甲状腺增生和结节形成。