碘与甲状腺呈因果关系，长期缺碘可引起地方性甲状腺肿、甲状腺功能减退症。
碘是人体必需的微量营养素，在体内具有非常重要的生理功能，是合成甲状腺激素的主要原料。研究表明，人体内碘大部分存在于甲状腺，碘缺乏和碘过多与甲状腺疾病的关系非常密切，也称为碘甲状腺功能亢进症，包括碘摄入过多引起的甲状腺功能亢进症。另外，碘在甲状腺疾病的治疗和预防中也有一定的作用，可以用碘-131治疗甲状腺功能亢进症。此外，甲状腺功能亢进症手术的前期准备可以使用碘剂，也可以使用碘剂治疗甲状腺中毒危象，甲状腺与碘的关系密切。