甲状腺囊肿一般不严重，但囊肿极有可能产生一定的压迫症状。
甲状腺囊肿是甲状腺最常见的良性疾病之一，一般无临床症状，无需特殊处理，应保持舒适，避免紧张焦虑，定期观察。如甲状腺功能减退，需口服激素药，定期复查甲状腺功能，调整用药剂量。甲状腺囊肿直径超过3cm、短时间快速增大引起疼痛、压迫气管神经引起呼吸困难、不排除声音嘶哑和甲状腺癌的情况下，应考虑手术处理，手术在全麻下进行。根据术中快速病理结果确定最终手术方式，良性病变需考虑局部切除，甲状腺癌需考虑甲状腺癌根治术和区域淋巴结清扫。