微波是300-30万兆赫之间的电磁波频率。微波治疗仪是一种磁控管，即采用恒磁场的真空二极管。从阴极发射电子，阳极作为电磁振动的电路发挥作用。被称为谐振器，在高压电流的作用下，在相互垂直的电场和磁场中激发电子，产生高频振动，产生微波。
由于人体是生物电站，是微波治疗仪与人体相互作用的基础，人体内的带电粒子、极性分子等在微波的作用下高速旋转、摩擦、碰撞，产生热能，使人体组织温度上升，血液循环丰富，引起蛋白坏死等生理反应。可以切除组织增加生物止痛，解除肌肉痉挛和灭菌。微波治疗仪在许多临床科室都很常用。