现代医学认为跖疣由人类乳头瘤病毒（HPV）所引起。是寻常疣的一种。通过直接接触传染所致（亦有自身接触），外伤和细胞免疫功能低下或缺陷也是重要原因。人类乳头瘤病毒可以通过皮肤的细小破损而直接接种并传染，因此皮损越来越多，再加上足部每天受力和鞋的摩擦，从而加重病情，使治疗起来难度加大。