卵巢囊肿肚子疼是可能是囊肿破裂、卵巢炎性囊肿、卵巢巧克力囊肿等原因引起的，具体分析如下：
1.囊肿破裂：如果患者患有卵巢囊肿，肚子疼，有可能是囊肿破裂导致的，卵巢囊肿破裂时会出现突发性的撕裂样疼痛，还可能会出现恶心、呕吐、晕厥等症状。
2.卵巢炎性囊肿：也有可能是卵巢炎性囊肿引起的，一般会伴有下腹部的持续疼痛，甚至是发热。
3.卵巢巧克力囊肿：还有可能是因为内膜异位到卵巢上而出现卵巢巧克力囊肿，患者可能会在月经期间出现进行性加重的腹痛。