药物流产后20天阴道还有褐色的分泌物，建议患者尽快去医院检查，了解是什么原因导致，对症进行治疗，具体内容如下：
如果是宫内有组织物残留，建议根据残留物的大小，在医生指导下选择用药物治疗或者是进行清宫手术。如果是炎症感染所引起的，一般建议在医生指导下使用抗炎杀菌的药物进行治疗，如果是子宫复旧不良所引起的，建议口服新生化颗粒、益母草颗粒等药物进行治疗，治疗期间，患者奥注意保持外阴清洁，避免病菌滋生。