通常情况下，人工流产5天后小腹疼痛可能是感染、胚胎组织残留导致的。具体分析如下：
做人工流产5天后小腹部出现疼痛，多见于妇科感染性疾病以及胚胎组织残留等因素，但是想明确诊断，患者还需要去医院做子宫B超检查。如果做子宫B超发现胚胎组织以及脱落的子宫内膜，残存在子宫内部，就可能是胚胎组织残留导致因素导致的，要及时进行清宫治疗。如果子宫B超显示正常，也可以做阴道分泌物的检查，从而明确病因。