阴道分泌物是咖啡色可以遵医嘱使用药物治疗。女性非月经期会有阴道咖啡色的分泌物，主要是由于卵巢囊肿、宫颈炎、子宫肌瘤、阴道炎等原因所致，如果患有阴道炎，应做阴道分泌物常规检查，查看有无滴虫、霉菌、细菌、支原体等。对于有实质性的病原菌的患者，可以遵医嘱使用甲硝唑阴道栓剂进行治疗；克霉唑阴道软胶囊是霉菌感染的首选药物；阴道用乳酸杆菌活菌胶囊可以用于细菌或支原体感染。在治疗的时候不要同房，一周后要到医院复查。