一般情况下，药物流产第三天肚子疼是正常的，通常是药物使子宫收缩引起的反应。
药物流产主要是在医生指导下服用米索前列醇、米非司酮等药物进行的。一般药物流产第三天会出现肚子疼的症状，而且是规律性的疼痛，这个是正常的反应，是药物作用下引起子宫收缩，这样才能帮助排出体内的胚囊组织，进而达到药物流产的目的，否则有可能会出现流产失败的情况，所以目前建议尽量不要过于担心，适当放松心情，继续观察流产的情况。