腺肌瘤和子宫肌瘤是有很大不同的，其主要区别在于，腺肌瘤通常与周围的组织分界不清，而子宫肌瘤则和周围的肌层具有非常清楚的边界。因此，患者在进行治疗时候，腺肌瘤往往不能一次性清除干净，而子宫肌瘤却能比较轻易的被剥除下来。
另外，腺肌瘤还可能会导致患者出现较为严重的痛经，而子宫肌瘤一般则不会，但腺肌瘤和子宫肌瘤可能会同时存在，有可能会出现误诊的现象。