卵巢囊肿切除后是否会影响怀孕，需要根据实际情况决定。如果双侧出现了卵巢囊肿，并且采取手术切除，就会彻底的导致不孕不育了，因为卵巢是分泌雌激素和卵子的器官，切除以后就完全丧失了人体生成卵子的部位，从而会导致不孕不育的。但如果是一侧卵巢囊肿切除，一般对怀孕的影响不大，因为切除了一半，还有另一侧的卵巢可以分泌身体的激素以及进行受孕。