如果是肉眼可见的霉菌性阴道炎或者显微镜下白带常规检查发现真菌感染，不建议进行人工流产手术。
人工流产手术需要使用机械式扩宫棒扩张宫颈，负压吸引棒深入宫腔，通过负压将宫腔内的组织，包括妊娠组的组织吸出。流产手术可能会将阴道细菌带入子宫腔。如果患者患有阴道炎，可以人为造成阴道炎逆行进入盆腔，导致盆腔炎。所以有霉菌感染时不建议流产手术。如果有霉菌感染，快速口服药物结合栓剂治疗2-3天，大部分霉菌感染可消退。患者也可以用消毒的方法，比如每天用碘伏消毒，等霉菌感染痊愈后再用手术。