功能性消化不良可以从日常生活习惯上进行调理，还可以辅助药物调理。
首先在饮食方面可以增加一些有助于消化的食物，同时患者应该保证进食的规律，尽量少食多餐，避免空腹，饭后要适当的运动，促进消化，入睡前要避免再次进食。在生活方面则要保持心情舒畅，规律睡眠，避免过度劳累和压力大的现象。
药物上也可以选择中成药物进行调理，如四磨汤口服液，此药有顺气降逆、消积止痛的功效，对于改善功能性消化不良有一定的效果。
还要注意，如果胃肠出现严重不适，影响日常工作和学习，要及时去医院进行就诊。