怀孕40天做人流是有一定的伤害，但伤害的大小取决于人流的方式。
如果是通过药物进行流产，对身体并不会造成特别大的伤害，流产后身体恢复的时间会比较快，但会出现流不干净的情况。如果是做无痛人流，对身体的伤害比药物流产大，但流不干净的可能性比较小。孕妇在做人流时需要到当地三甲及以上医院找专业的医生，不建议在私立医院做流产。