人流第三天肚子疼可能是子宫腔内感染，也可能是流产不全的原因。
人流手术通常会对子宫内膜造成一定的损伤，出现阴部出血症状，如果个人的卫生护理不当，容易造成子宫内膜感染，引起子宫内膜炎疾病，所以会出现肚子疼痛症状，另外流产不全有宫腔内残留现象，也会伴有肚子疼痛。
人流后需要多注意休息，避免吃一些寒凉或者是刺激性的食物，还要做好保暖护理。