霉菌性阴道炎患者发现怀孕后，治疗方法如下：
第一、可以采用口服药物治疗霉菌性阴道炎，但药物可能对胚胎的发育有明显的不良影响。这种情况下，需要仔细考虑胎儿要不要留下来；
第二、如果是单纯通过阴道内放置药物来治疗霉菌性阴道炎，局部药物对胎儿发育的影响并不明显，只要不流产，妊娠就可以继续。当然，怀孕后一般需要暂时中止治疗；
第三、硝呋太尔片是一种广谱妇科抗菌药物，可用于治疗霉菌性阴道炎，且不影响胎儿发育。如果怀孕期间症状严重，也可以考虑使用。