怀孕40天一般可以B超，能够排除宫外孕的情况。
在怀孕之后通常需要进行B超检查，能够有效判断是否是属于宫内妊娠的情况，而在怀孕40天的时候，孕囊已经处于子宫内膜内，因此做B超检查能够排除宫外孕的情况，但每个人的体质不一样，如果受精卵着床比较晚，可能在40天的时候无法进行判断。
如果在怀孕40天没有看到孕囊，可以隔一段时间再次进行B超检查。