怀孕吃了三个月的药对胎儿的影响比较大。在这个时期孩子已经发育好了，吃药可能会导致孩子畸形。在怀孕过程中如有不适，建议去医院时在医生指导下服药，切勿私自服药，以免对宝宝造成一定伤害。平时生活中注意卫生，避免感染和炎症。可以提前服用叶酸片，可以预防胎儿神经管畸形，加强营养，保持孕期好心情，注意日常的作息规律。