怀孕肾疼是由于怀孕之后子宫增大压迫输尿管导致了肾积水，或者有肾结石的情况，所以会引起疼痛。
怀孕以后孕激素水平升高，泌尿系统平滑肌张力降低，输尿管增粗且蠕动减弱，尿流缓慢，肾盂及输尿管从妊娠中期开始轻度扩张。并且右侧输尿管常常受右旋的子宫压迫，发生肾盂积水，所以会出现肾区的疼痛。主要是由于尿流缓慢，容易发生急性肾盂肾炎，导致肾区疼痛。