在有妇科炎症的情况下，发现怀孕了，一般要根据实际严正决定如何治疗，例如患有阴道炎症可以选择阴道局部上药，并不会影响胚胎组织的发育。
建议：如果患有盆腔炎症是不建议在怀孕期间进行治疗的，因为盆腔炎症，一般需要口服消炎药或者选择盆腔理疗仪器，中药灌肠的方法治疗会影响胚胎组织的正常生长发育，甚至导致流产。