怀孕三个月会有孕吐等不良反应，表现为厌食、恶心、甚至呕吐，严重的可有四肢乏力。最严重的孕吐可以表现为神经系统症状，比如剧烈头痛、视物不清等，称为沃尼克综合征，对于沃尼克综合征建议终止妊娠。
孕三个月以后，妊娠反应逐渐减弱、消退，也有个别女性妊娠反应可以持续存在，甚至持续到分娩。孕三个月以后子宫逐渐增大，开始长出盆腔，也就是俗话说的出怀。