怀孕有尖锐湿疣患者可在孕36周前用50%三氯乙酸治疗。如果怀孕期间皮损生长迅速，也可以考虑液氮、冷冻疗法或手术疗法。
三氯乙酸是一种腐蚀性的收敛剂，通过沉淀血管细胞来达到治疗目的。因为不被身体吸收，所以很少产生局部反应，对胎儿没有不良影响。需要每周服药，直到康复，在医生的指导下进行治疗。如果没有特殊原因，不会因为尖锐湿疣而中止妊娠。为了避免对胎儿造成影响，近足月妊娠或已足月妊娠者一般不服药。