巧克力囊肿患者如果成功怀孕，一般不需要孕期特殊治疗。孕期b超检查时注意随访观察。随着孕周的增加，囊肿可能会逐渐缩小，甚至消失。如果巧克力囊肿较大，导致孕期腹痛或阴道出血，可以及时去医院检查。
巧克力囊肿是由子宫内膜异位症引起的，通常会引起痛经、月经紊乱和不孕。巧克力囊肿发病率高。对于症状较轻有生育要求的患者，可以明确诊断后再进行药物治疗。重疾者，可保留生育功能手术。