如果卵巢囊肿很小，女性仍然可以怀孕。但有些女性卵巢囊肿较大，或者已经影响到女性排卵，可能会对怀孕造成一定影响。
卵巢囊肿分为生理型和病理型。生理性囊肿会随着月经或再次到来而改变。也许这次是月经前发现卵巢囊肿，然后在下次月经后消失，或者完全透明，只有3-4cm长。有一种观念认为生理性囊肿不需要特殊治疗，只需要观察。患有卵巢囊肿的女性在准备怀孕时一定要请医生做决定。有些囊肿需要积极怀孕，对患者有好处，但有些囊肿必须由医生排除，否则怀孕后还会继续生长。