怀孕三个月肚子疼可能是正常现象，也可能是流产先兆或宫外孕。
孕早期肚子疼的原因很多，有些是正常的生理现象。一般生理性腹痛不是很严重，发病时间很短。生理因素引起的胃痛是怀孕的正常反应，不用太担心。但病理因素引起的胃痛需要高度警惕，因为很可能是流产先兆或宫外孕。怀孕早期的胃痛大多可以归因于子宫因怀孕而变大及其韧带被牵拉。此外，孕期器官与器官相对位置的改变，以及受到压迫，也会引起小腹隐痛，甚至酸痛。这些孕妇肚子疼是正常的。有些孕妇肚子疼可能预示着一些不好的情况，最常见的有先兆流产、宫外孕、子宫肌瘤等。建议尽早去医院检查，以免耽误病情。