霉菌性龟头炎治疗是外部上药，使用一些抗菌类的药物，口服药也要同时进行。
霉菌性龟头炎是因为真菌，是包皮与龟头产生炎症，会出现龟头痒痛，尿频，尿急，尿痛。外部给药抗菌，同时进行口服药消炎，治病期间禁止性生活，女性也要及时检查，如发现霉菌性阴道炎，也要及时治疗，保证卫生，要经常清洗龟头和包皮。
患者日常要注意局部的卫生，定期清洗，必要时行包皮环切术，夫妻双方若有霉菌感染应同时治疗。