两只眼睛大小不一样可以通过手术矫正，也可以不做治疗，需要具体情况具体分析。
每个人的眼睛大小都是不一样的，如果不明显就没必要治疗，但如果是病理原因导致的眼睛异常，比如上睑下垂，建议通过手术治疗来矫正，常见的有双眼皮手术、内外眦成形术、眼睑下垂矫正等等，具体采用哪种方法，建议患者到正规的医院咨询医生，听从医生建议。