肥厚型心肌病病理生理改变首先是左室流出道梗阻，肥厚型心肌病患者肥厚的间隔是流出道，是因流体力学上的射流效应是流出道血流速度加快。二尖瓣前叶在心室收缩机向前移动，可能会导致左室流出道狭窄，引起左室腔与左室流出道间出现收缩期压力差，这属于肥厚型心肌病具有的特征改变。有些患者还会出现左手收缩功能和舒张功能障碍。