新生儿心肌酶高是否严重，要看病情和临床症状，有的不严重，有的严重，如下：
1.不严重：新生儿只是心肌酶高，没有任何不适，如出汗、经常哭闹、食欲不振、精神状态差等，一般不严重。这可能是由于分娩时宫内窘迫导致缺氧。缺氧症状缓解后，心肌酶值会恢复正常。
2.重症：新生儿患有病毒感染引起的疾病，如轮状病毒肠炎。因为病毒产生的毒素可以直接损伤心肌细胞，从而增加病毒性心肌炎的发病率，病毒性心肌炎更为严重，或者因为新生儿肺炎，肺部气体交换面积减少，会出现不同程度的缺氧。肺炎症状越严重，对心肌的损害越严重，所以越严重。建议家长积极治疗原发病以降低心肌酶值，降低心肌炎风险。