矮小症确诊后，建议儿童内分泌科完善垂体磁共振、生长激素激发试验等检查，是否住院要看就诊的医院。疾病引起者病因包括内分泌异常，骨骼病变或其它疾病等，其中以生长激素缺乏最多。其次是性早熟导致的身材矮小，还有部分由于宫内发育迟缓或染色体异常等引起。非疾病引起的矮小症包括家族性矮小、体质性矮小、生理性青春发育延迟等。
常见的治疗方法包括生长激素替代治疗、激素替代治疗、人工合成同化类固醇治疗、病因治疗等。小儿矮小症病因复杂，治愈可能性不大。疾病引起者病因包括内分泌异常，骨骼病变或其它疾病等，其中以生长激素缺乏最多。