儿童分泌性中耳炎可以分为药物治疗跟手术治疗。药物治疗主要是应用合理的抗生素，常用第三代头孢菌素类的抗生素，可以口服黏膜促排剂，以降低咽鼓管黏膜表面的张力，改善咽鼓管开放功能的压力。
如果药物治疗无效或者改善不明显时，可以行手术治疗，常用的手术治疗是有鼓膜穿刺抽液或者鼓膜切开术，还可以行鼓室置管术。如果小孩儿伴有明显鼻塞时，需要查鼻咽部以及鼻腔疾病，如果伴有腺样体肥大或者鼻息肉者，需要行腺样体、鼻息肉的切除术。如果扁桃体过度肥大，有时也与分泌性中耳炎复发有一定的关系，建议行扁桃体的切除术。