治疗乳腺囊性增生症时，可用中药或中成药调整。协调清洗和调整卵巢功能，包括疏肝理气。常用口服中药逍遥散，局限性乳腺囊性增生病，月经1至10天后复查，肿块变软缩小或消退可继续观察中药治疗。局限性乳腺增生病肿瘤必须明显区别于乳腺癌乳腺癌肿块更明显、质地硬，与周围乳腺有明显差异，有时腋窝淋巴结肿大。
根据乳腺囊性增生症的特点和临床症状，本病有无恶变可能上升，乳腺癌可能与本病同时存在，为了发现可能早期存在的乳腺癌，每2~3个月在医院复查一次。