男性生殖器疱疹能不能治根，目前还在研究过程中。抗病毒治疗不能完全杀灭这种病毒，它会隐藏在骶神经节内，一旦身体的免疫力降低以后，潜伏的病毒会伺机而动，直接侵袭到外生殖器皮肤和黏膜，从而导致生殖器疱疹的再次发作。如果想要降低发病几率，需要提高自身的免疫力。在治疗方面，在正规治疗的同时，也可以用提高免疫力的药物。