一般慢性乙肝不需做手术，病情比较严重，出现肝硬化、肝衰竭时，可以进行肝移植手术。现在临床上对于乙肝，比较满意的目标就是让乙肝病毒得到控制，造成这个感染是长期的，所以也需要一个长期治疗过程。通过长期的吃药，长期的治疗，抗病毒治疗的目的是抑制病毒复制，因此，符合适应症者应尽可能积极进行抗病毒治疗。
慢性乙型肝炎的抗病毒治疗以口服核苷酸类似物为主，如富马酸丙酚替诺福韦片（科菲克），是慢性乙型肝炎治疗的一线推荐药物，可靶向直达肝脏细胞，在肝脏转化为有效活性成分替诺福韦，能够强效抑制病毒。此药的耐药性较低，对骨骼，及肾脏的损伤较小。