区分肛瘘还是痔疮可以从分泌物及排泄物或者特征来区分。
痔疮，一般肛门较少有分泌物，当内痔严重脱出时，有分泌物存在，但分泌物多稀薄，而肛瘘多为脓性物，多伴有臭味，痔疮生长在肛门缘，与肛门紧紧相连接；而肛瘘之外口，距肛缘有一定距离，且瘘口鲜红或有凹陷瘢痕，按压可有脓汁从瘘口流出，用手扪之，自觉有条索状物从瘘外口延伸向肛门。
建立正常的膳食习惯，防治便秘和腹泻，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用，应多吃清淡含丰富维生素的食物。