垂盆草是有副作用的，会对肝脏造成其他影响，特别孕妇禁用。
盆垂草的副作用是因为它含有的甲基异石榴皮碱等生物碱成分，会刺激胃肠道，使胃部有灼痛感。还会出现恶心、肠鸣、腹泻以及常有饥饿感等症状。而且，有脾胃虚寒的人以及过敏体质的人，要谨慎服用，否则容易导致病症加重或造成身体不适。
建议服用期间要多饮水，多吃新鲜水果蔬菜，不要吃辛辣刺激性的食物。脾胃虚寒及无实火的患者和孕妇一定要慎用。对垂盆草过敏的患者请勿服用。垂盆草颗粒为处方类药物，请患者们切忌自行服用药物，一定要在医师正确指导下服用药物，用量用法一定要遵医嘱，如需与其他药物同时服用也请咨询医师确定药物间不会产生相互作用影响疗效。