传染性软疣的治疗方法有挤疣疗法，临床最常用，操作简单、治疗效果好。利用眼科镊子，将软疣小体去除，表面涂抹抗菌药物，但此疗法有一定疼痛感，年龄较小者多无法耐受，对于病变局限、疼痛明显者，可在局麻下进行治疗。还有冷冻、刮疣，以及中国传统医学的火针疗法，也是通过去除软疣小体，达到治疗效果。