晚期的艾滋病主要的症状有营养不良，由于进食量逐渐减少，营养状况会越来越差，而且容易出现持续的腹泻，因此晚期会出现严重的营养不良，体重明显降低，会进一步削弱免疫力。其次并发各种感染，由于免疫力的严重不足，自身很容易受到外界病原体的感染，甚至正常的寄生菌也可能会成为致病菌。