怀孕后吃避孕药，可能会诱发流产和出现胚胎发育异常，导致胎儿畸形的情况发生。紧急避孕药中含有大量的激素成分，这种激素成分可能会导致内分泌紊乱，也会出现严重的胃肠道反应，甚至会增加血栓等疾病的几率增加。
女性在不知道怀孕的情况下，如果服用紧急避孕药，最好去医院在医生的指导下，根据孕周判断对胎儿造成不利影响的几率大小，采取相应的措施。女性在备孕期间尽量不要服用紧急避孕药，甚至其他的药物，如镇静、抗结核等药物，需要停止服用，以免对胎儿的生长发育造成不利的影响。