灌肠会出现直肠炎等感染性疾病发生，也有可能损伤直肠粘膜。
直肠给药是一种常用的给药方式，直肠有丰富的毛细血管网，对药物吸收率很高。但小孩的肠道内环境还不是很稳定，不能长期、反复进行灌肠治疗，这样容易引起直肠粘膜破损，也有可能药物损伤直肠黏膜，出现直肠炎等感染性疾病发生。
如果已经进行过灌肠，当天内不建议再次采用直肠灌肠治疗。如果是发烧建议先去正规医院抽血化验，对症用药。一般主张口服退烧药的。