口服紧急避孕药很可能引起内分泌失调，从而对每个月的安全期和排卵期无法做出准确推断。
如果经常服用，还有可能造成闭经和不育不孕的后果，所以为了减少对身体的伤害，事前做好避孕措施有时可以出现不规则出血等症状，避孕药是通过抑制卵子产生。阻止卵子和精子的结合，改变子宫内膜功能和形态达到避孕的效果，这都是紧急避孕药的副作用，这些症状是可以自行恢复的，不会对身体造成重大损害。另外紧急避孕药不能保证百分百避孕成功，用药之后还是要观察下次月经时间。
建议在性生活之前和性生活后12小时之内口服效果才好，只要规范使用是不会怀孕的。