鼓膜穿刺手术后，主要的危害包括以下的几点：第一、患者中耳炎的症状并没有得到解决，在穿刺之后，中耳腔内依然反复的会有渗出，患者可能需要再次的行手术治疗。第二、主要考虑如果手术者穿刺针进得过深，特别容易导致患者出现恶心、眩晕，还有呕吐的情况。第三、鼓膜穿刺之后，如果患者耳道里面进水，有感染的情况，容易导致患者鼓膜穿孔，不愈合。如果穿孔特别的大会影响患者的听力，有的时候会伴有耳鸣，因为外耳道与中耳腔相通了，所以患者可能经常会导致中耳腔感染会出现耳朵流脓。
建议分泌性中耳炎的患者一般建议首先使用保守治疗，必要的时候再行鼓膜穿刺手术。