医院的检查费用是由省市物价部门统一定价的，所以各个地方的定价也会存在一定的差别。一般情况下，支原体衣原体的检查费用大约在100-200元之间。
诊断支原体、衣原体感染需要经过实验室检查，不能只根据症状和体征诊断为支原体、衣原体感染，目前检查支原体感染用的方法有培养法和血清学检查法。支原体培养法的价格稍微比较贵在200元左右，而血清学检查法在100左右。