大量食用大蒜会对眼睛造成刺激作用，容易引起眼睑炎、眼结膜炎。
因为大蒜能够杀菌，这已是众所周知的事情，临床上有采用大蒜素作抗微生物治疗的。而醋的主要成分是醋酸，也有杀菌的作用，不过食用过多容易会造成胃酸浓度上升，有些人吃多了容易造成胃粘膜损伤，胃痛。因此醋泡大蒜并不是吃得越多越好的。
建议大蒜不宜空腹食用，胃溃疡患者和患有头痛、咳嗽、牙疼等疾病的人群，也不宜食用大蒜。大蒜吃多了也会影响维生素B的吸收。