患者体内有肾囊肿并不会产生多大危害，因此不用过度担心，只有在囊肿特别巨大以及超过十公分时，可能才会存在明显的症状。
在囊肿特别巨大以及超过十公分时，可能才会存在腰酸腰痛，如果是囊肿较小，小于四公分，在肾脏内对患者是不会产生任何危害的，也不用过度担心，只需要每年定期去泌尿外科就诊，检查一次泌尿系彩超，复查监测囊肿的大小变化即可。对于肾囊肿属于肾脏常见的良性占位性病变，不会引起患者生命健康受损，患者只有在囊肿较大压迫肾盂，引起肾盂积水，才需要进行腹腔镜下肾囊肿去顶减压术。
单纯肾囊肿进展缓慢，预后良好，不须外科治疗干预，半年或一年B超复查一次即可。对于直径大于4cm的单纯肾囊肿或是可疑恶变的囊肿，应考虑手术治疗。